Se você trabalha com muitas janelas abertas ao mesmo tempo, este aplicativo pode ser de grande ajuda. Conheça o GhostWin.

O GhostWin é uma solução elegante para tornar as janelas do Windows transparentes:

Você pode escolher níveis de transparência individuais para cada janela, além de definir quais janelas devem ficar sempre no topo, mesmo que os programas não possuam esta opção.

O GhostWin é gratuito, faça download aqui.